小分子的物化特性可分類為Basic、Structure、Geometry、LogP、Drugable及Name類別，其下有各種物化計算描述子，可進行小分子物化特徵描述計算。
會員登載純小分子結構資料於TDEC資料庫並完成審核上線後，物化特性計算管理系統會將該結構的物化特性數值計算回傳並儲存於本資料庫中，待其它使用者查尋該筆化合物時，數據將會自資料庫中回傳於前端網頁供查尋使用。
計算物化數據可以協助藥物研發人員進行藥物開發可行性評估，例如: Drugable類別的Lipinski's rule of five可用於評估該化合物成藥的可能性，作為新藥開發的參考數據。
TDEC網站的物化特性計算來自於Open Babel及RDKit技術支持[1-3]，2D結構畫板核心技術則是使用JSME[4]及3D結構視覺化圖形核心技術則是使用JSmol[5]。