物化特性數據計算

台灣藥物樣品資料庫提供小分子物化特性計算

小分子的物化特性主要包含化學結構的物理化學特性與其 ADMET 特徵預測兩大類別。此二類資訊皆由多種物化計算描述子(descriptors)進行量化與特徵化,用以描繪化合物的理化行為與藥代動力學特性。這些參數可作為新藥開發過程中評估化合物成藥性的重要依據,進而有效提升藥物研發的效率與成功率。

說明

會員於 TDEC 平台登載小分子結構資料並經審核上線後,物化特性計算管理系統即進行該化合物之物理化學特性與 ADMET 特徵值計算與整合,並將所得數據回傳與儲存於資料庫中。其結果同步顯示於前端網頁介面,供使用者依據相關特徵數據條件進行查詢與篩選。

雖然物化數據與 ADMET 特徵值為預測性資料,但仍可有效輔助藥物研發人員進行化合物可行性與成藥性評估。例如,Drugable 分類中之 Lipinski’s Rule of Five 可作為判定化合物具備口服成藥潛能的重要依據,為早期藥物開發提供有力的參考資訊。

TDEC 平台之物化特性計算來自Open Babel 與 RDKit 技術支持 [1–3];

2D 結構編輯與視覺化介面採用 JSME 為核心技術 [4];

3D 結構視覺化則採用 JSmol 進行渲染與互動展示 [5];

而 ADMET 特徵值則透過 ADMETlab 3.0 平台預測獲得 [6]。

參考資料

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